Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms