Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD1P0DJD0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms