Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC2BP0DI82 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2BP0DI82 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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