Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC175P0C221 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms