Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF3P09919 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms