Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD4P09016 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms