Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINA1P01009 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINA1P01009 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms