Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NBNO60934 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NBNO60934 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBNO60934 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NBNO60934 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms