Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMDSO60547 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms