Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3AO14802 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms