Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
APAF1O14727 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms