Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C1C5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C1C5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C1C5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms