Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-2B6SEH9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms