Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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