Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CFAP73A6NFT4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms