Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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