Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP3Q9Y446 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms