Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms