Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms