Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF346Q9UL40 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms