Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBE1Q9UJT0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms