Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDP1Q9P0J1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.4 ms