Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC52A1Q9NWF4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A1Q9NWF4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms