Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms