Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFDN4Q9NQP4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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