Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms