Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3GQ9HC16 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms