Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASXL3Q9C0F0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms