Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms