Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms