Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2AFJQ9BTM1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms