Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms