Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TCF12Q99081 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms