Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms