Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC7Q96M83 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms