Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC136Q96JN2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms