Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms