Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCE1Q969G3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms