Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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COPS9Q8WXC6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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