Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2BQ8NHM5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2BQ8NHM5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms