Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMER3Q8N944 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms