Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms