Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms