Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX29P2Q8IUI4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms