Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM29Q86T20 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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