Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SV2AQ7L0J3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms