Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED8Q6PL24 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms