Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms