Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REP15Q6BDI9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms