Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms